Le aree marine protette sono 29 oltre a 2 parchi sommersi che tutelano complessivamente circa 228mila ettari di mare e circa 700 chilometri di costa. Ogni area è suddivisa, generalmente, in tre tipologie di zone con diversi gradi di tutela. Sono costituite da ambienti marini, dati dalle acque, dai fondali e dai tratti di costa prospicienti, che presentano un rilevante interesse per le caratteristiche naturali, geomorfologiche, fisiche, biochimiche con particolare riguardo alla flora e alla fauna marine e costiere e per l'importanza scientifica, ecologica, culturale, educativa ed economica che rivestono.
Vi è inoltre il Santuario Internazionale dei mammiferi marini, detto anche Santuario dei Cetacei.
AREE MARINE PROTETTE ISTITUITE
- Area marina protetta Capo Caccia - Isola Piana
- Area marina protetta Capo Carbonara
- Area marina protetta Capo Gallo - Isola delle Femmine
- Area marina protetta Capo Milazzo
- Area marina protetta Capo Rizzuto
- Area marina protetta Capo Testa - Punta Falcone
- Area marina protetta Cinque Terre
- Area marina protetta Costa degli Infreschi e della Masseta
- Area marina protetta Isole Egadi
- Area marina protetta Isola dell'Asinara
- Area marina protetta Isola di Bergeggi
- Area marina protetta Isola di Ustica
- Area marina protetta Isole di Ventotene e Santo Stefano
- Area marina protetta Isole Ciclopi
- Area marina protetta Isole Pelagie
- Area marina protetta Isole Tremiti
- Area marina protetta Miramare
- Area marina protetta Penisola del Sinis - Isola di Mal di Ventre
- Area marina protetta Plemmirio
- Area marina protetta Porto Cesareo
- Area marina protetta Portofino
- Area marina protetta Punta Campanella
- Area marina protetta Regno di Nettuno
- Area marina protetta Santa Maria di Castellabate
- Area marina protetta Secche della Meloria
- Area marina protetta Secche di Tor Paterno
- Area marina protetta Tavolara - Punta Coda Cavallo
- Area marina protetta Torre del Cerrano
- Area marina protetta Torre Guaceto
PARCHI SOMMERSI